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公司新聞

中國人自己的單細(xì)胞測序儀來了!

來源:     發(fā)布時(shí)間:2018-11-08    作者:admin
過去兩年有一項(xiàng)大熱的技術(shù),大量研究人員通過這項(xiàng)技術(shù)解決重要科學(xué)問題,發(fā)表了大量學(xué)術(shù)文章,這項(xiàng)技術(shù)便是單細(xì)胞測序技術(shù)。

Drop-seq單細(xì)胞測序儀 
 
單細(xì)胞測序技術(shù),在這兩年得到了蓬勃發(fā)展。一些高通量的單細(xì)胞測序平臺開始為大家所熟知。有10×genomics單細(xì)胞測序平臺、以及Fluidigm、WaferGen、Illumina/Bio-Rad等。
這些平臺減少了單細(xì)胞測序的成本,使得單個(gè)細(xì)胞的測序成本變得低。雖然單個(gè)細(xì)胞的成本減少了,但一個(gè)樣本需要產(chǎn)生大量細(xì)胞的數(shù)據(jù),所以單個(gè)樣本的成本并沒有很低。大多數(shù)的研究者會因這幾十萬或上百萬的測序成本而對單細(xì)胞測序研究望而卻步。有些希望從事單細(xì)胞研究或者希望提供單細(xì)胞測序服務(wù)的單位,也會因?yàn)闇y序平臺高昂的價(jià)格而猶豫不決。
在這種形式下,上海凈信潛心研發(fā)兩年多,推出了單細(xì)胞測序平臺。該平臺基于Drop-seq的技術(shù)原理,能夠完成數(shù)千或上萬細(xì)胞的單細(xì)胞測序。
大家所熟知的10×genomics單細(xì)胞胞測序平臺依托的技術(shù)手段稱之為inDrop-seq,論文在2015年發(fā)表與Cell雜志。該方法利用微液滴技術(shù)將帶有條形碼、索引分子、引物及其他的凝膠珠與單細(xì)胞混合。每個(gè)液滴內(nèi)開展逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),以產(chǎn)生測序所用的帶有條形碼的cDNA。

Drop-seq單細(xì)胞測序儀 
10×genomics單細(xì)胞測序平臺原理圖
有意思的是,凈信使用的Drop-seq技術(shù)與inDrop-seq技術(shù)發(fā)表與同一期的Cell雜志上。Drop-seq也是利用微流控技術(shù)將細(xì)胞分開,并與帶有特定條形碼的磁珠混合。磁珠上的Poly(dT)將細(xì)胞內(nèi)的信使RNA捕獲。收集磁珠凈信逆轉(zhuǎn)錄和擴(kuò)增,得到測序所用的帶有條形碼的cDNA。與inDrop-seq不同的是,Drop-seq的逆轉(zhuǎn)錄的過程是在液滴外進(jìn)行的,這樣逆轉(zhuǎn)錄的效率會高。
Drop-seq單細(xì)胞測序儀 
凈信單細(xì)胞測序儀原理圖
凈信的單細(xì)胞測序儀不管是從原理還是從測試結(jié)果看,它每個(gè)樣本能夠產(chǎn)生5000~10000個(gè)細(xì)胞,對上機(jī)樣本沒那么多的要求。為減少實(shí)驗(yàn)失敗造成的損失,機(jī)器還添加了能夠監(jiān)控實(shí)驗(yàn)過程的系統(tǒng),一旦出現(xiàn)管道堵塞等情況,便可以及時(shí)止損。而關(guān)鍵的還是:該平臺不論是從機(jī)器的購買成本,還是試劑耗材的成本都較低。該平臺的問世,再次將單細(xì)胞測序的價(jià)格拉低了一個(gè)臺階,使得研究人員能夠去利用這一技術(shù)手段進(jìn)行研究工作。
Drop-seq單細(xì)胞測序儀 
 
凈信單細(xì)胞測序儀 樣機(jī)圖
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