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表觀遺傳學(xué)|ChIP小美非接觸式超聲處理法-超聲波

來源:     發(fā)布時間:2020-12-04    作者:admin

  在基因調(diào)控領(lǐng)域,表觀遺傳學(xué)一直是比較熱門的話題,而染色質(zhì)免疫沉淀 (ChIP) 是表觀遺傳學(xué)中一項常用的技術(shù)。利用 ChIP,研究人員可在整個基因組內(nèi)識別目的蛋白結(jié)合的特定基因和序列,為其調(diào)控功能和機(jī)制提供關(guān)鍵線索。通過解析蛋白質(zhì)-DNA 相互作用的時間和空間動態(tài),ChIP 提供了對核心生物學(xué)過程和疾病病理學(xué)的見解。

  與絕大多數(shù)實(shí)驗(yàn)方法相同,ChIP也遵循著GIGO原則。如果你的染色質(zhì)原材料不佳,是很難得到理想的實(shí)驗(yàn)結(jié)果的。同時,如果你的原材料OK,下一步片段化處理沒有做好,仍然是徒勞。目前我們一般通過超聲或者酶切將染色質(zhì)片斷打成幾百Bp,但普通超聲波破碎儀很難拿捏。超聲時間過長或力度過強(qiáng)都會令蛋白變性,使其與核酸分離或者破壞抗體識別的抗原表位。這種方案需要進(jìn)行大量的優(yōu)化,而傳統(tǒng)的探頭超聲波破碎儀,探頭與樣品直接接觸,一次只能處理一個樣品,實(shí)驗(yàn)周期長。對于多個樣品,需要重復(fù)使用同一探頭,容易造成樣品交叉污染。由于每次探頭插入樣品的深度不同,每次超聲的能量分布也不盡相同,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性和準(zhǔn)確性。此外,由于不能采用封閉系統(tǒng),在超聲過程中產(chǎn)生的氣霧或者泡沫會擴(kuò)散到環(huán)境中,造成潛在的生物危險。

  而小美XM-150A非接觸式超聲波破碎儀(DNA打斷儀),一次最多可同時處理32個樣品,把復(fù)雜的多參數(shù)影響直觀數(shù)據(jù)化,解決了繁雜的參數(shù)誤差,做到準(zhǔn)確可控效率高;無需頻繁操作探頭,各樣品均在單獨(dú)的全封閉試管中,避免交叉污染,也不會產(chǎn)生感染性飛沫,有效保護(hù)了研究人員的人身安全;采用4℃水浴超聲波,能量分布均勻,超聲作用完全;超聲參數(shù)設(shè)置靈活,實(shí)驗(yàn)步驟標(biāo)準(zhǔn)化,實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好,結(jié)果可靠性高。

  XM-150A非接觸超聲波破碎儀主要用于細(xì)菌細(xì)胞破碎,蛋白質(zhì)抽提、二代測序樣本 DNA 片段化、免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)、霉菌孢子破碎、乳化、均質(zhì)、加速溶解、催化反應(yīng)。它是利用磁致伸縮共振超聲技術(shù)破碎樣本, 核酸樣本破碎大小范圍為1kb~ 200bp 或更小。這款超聲可持續(xù)工作60分鐘,也可間隙工作(間隙時間:0.1-999秒)。樣品超聲時能自動定速持續(xù)旋轉(zhuǎn),確保樣品破碎效果達(dá)到一致。還具有過熱保護(hù)功能及溫度監(jiān)測功能,實(shí)驗(yàn)人員可放心使用。

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